Il Museo della Città, situato all'interno del cinquecentesco Palazzo di San Sebastiano, ospita e valorizza opere appartenenti alle Collezioni Civiche che formavano l’ottocentesco Museo Patrio.
Il nuovo percorso espositivo inaugurato nel 2023, MACA Mantova Collezioni Antiche, è incentrato sui personaggi che hanno contribuito a formare il patrimonio culturale della città e comprende la collezione egizia "Giuseppe Acerbi" e quella mesopotamica "Ugo Sissa", trasferite dal Museo Civico di Palazzo Te. Il Museo accoglie al suo interno anche il Centro Studi e Documentazione delle Collezioni Civiche.

Il ricco patrimonio conservato all'interno del museo è catalogato in Lombardia Beni Culturali.

Il Museo della Città, situato all'interno dell'area della città Patrimonio UNESCO, è stato riconosciuto come Museo nel 2004.