Il Museo Civico di Storia Naturale è la più grande collezione naturalistica di reperti locali della provincia di Sondrio. La sezione di Scienze della Terra sviluppata in tre sale guida i visitatori  attraverso gli aspetti più significativi della morfologia e della geologia della provincia di Sondrio. La sezione faunistica comprende la sala dedicata a Pesci, Anfibi e Rettili, le vetrine degli Uccelli e grandi diorami, rappresentativi dei vari ambienti in cui sono esposti esemplari di uccelli e mammiferi della ricca fauna locale. La sezione si conclude con una sala dedicata agli insetti.

Il ricco patrimonio conservato all'interno del museo è catalogato in Lombardia Beni Culturali.

Il Museo è stato riconosciuto come Raccolta Museale nel 2004.