Il Museo di Archeologia fu fondato nel 1819 da Pietro Vittorio Aldini con funzioni eminentemente didattiche. Ospita reperti che vanno dalla preistoria al tardo antico, con una piccola sezione egizia: sculture, capitelli, vasellame domestico, oggetti fittili, monete, iscrizioni, ma anche falsi e pseudo antichi, che furono acquistati con l’intento di favorire il confronto di tecniche, tematiche, gusto e stile.