Le origini del Museo di Mineralogia risalgono alla fine del XVIII secolo. Comprende una collezione generale sistematica e una regionale, dove sono raccolti i minerali più rappresentativi di ogni regione italiana. Sono inoltre esposte: la “Collezione Angelo Bianchi”, che comprende minerali della Val Devero raccolti agli inizi degli anni '20 del Novecento, la “Collezione di Meteoriti”, tra cui una meteorite caduta nel 1794 nei pressi di Siena, raccolta da Lazzaro Spallanzani e la “Collezione di diaspri siberiani”, donata dal Duca Melzi D’Eril nel 1802.