Il Museo nasce nei primi anni Venti del secolo scorso ad opera di Goffredo Bellini, collezionista, ricercatore, appassionato di storia locale, che tra fine '800 e i primi decenni del '900 raduna reperti archeologici e cimeli di guerra, opere grafiche e pittoriche e libri antichi, documenti e autografi e oggetti d’arte sacra, creando una vera e propria collezione, con sezioni che spaziano dall’archeologia all’arte, dalla storia militare alle scienze naturalistiche.
Il ricco patrimonio conservato all'interno del museo è catalogato in Lombardia Beni Culturali.
Il Museo Civico Goffredo Bellini è stato riconosciuto come Museo provvisoriamente nel 2004 e definitivamente nel 2007.