Ospitato all’interno del complesso che riunisce l’Istituto e la casa natale di Paolo VI, il Museo nasce dalla raccolta privata del pontefice bresciano e comprende oltre 7000 opere di artisti contemporanei. La collezione, disposta su due piani, contiene un itinerario principale di visita, e sezioni specificamente dedicate alla grafica e alla medaglistica.
Tra i nomi più significativi degli autori esposti, spiccano Salvador Dalì, Pablo Picasso, Henri Matisse, Hans Hartung, René Magritte, Marc Chagall, Georges Rouault, Mario Sironi, Gino Severini, Lucio Fontana.

La Collezione Paolo VI - Arte Contemporanea è stata riconosciuta come Museo nel 2014.